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    合作交流丨中國科學院遺傳與發育研究所梁承志研究員訪問菲沙基因

    發布時間:2020-1-20 15:18:32閱讀次數: 分享到:

            日前,梁承志研究員應邀來菲沙基因北京研發中心考察交流,公司總經理陳東生及北京研發中心負責人和技術骨干參與接待。


            公司總經理陳東生就菲沙基因近年來在科研服務和臨床醫學中的發展向梁教授進行了介紹,他指出目前菲沙基因以三代測序、三維基因組學和表觀遺傳學為技術平臺實現了臨床科研服務,通過與各大醫院進行臨床重點科研合作,在腫瘤和遺傳病基因組醫學方向已匯集了大量的醫學科研和臨床資源,積累了大量的臨床樣本數據,正在逐漸形成“科研服務-產業化”良性循環。


            梁老師對公司目前在醫學科研方向上所做的工作給予重復肯定,并從企業技術創新的角度對公司的發展給予了指導意見,他指出目前公司的發展應利用好已經積累的大量臨床樣本,挖掘有效信息來揭示疾病發展規律,疾病地區分布和疾病精準預測。著重開發具備自主知識產權的產品和技術,并在此基礎上,一方面加強科研創新,一方面形成標準化的生產模式。


            雙方就HERA軟件的產業化應用達成共識,后續將著重在大型基因組、復雜基因組組裝研究方向加強合作,加快軟件測試和項目應用進程,共同推進HERE軟件的集成,使之成為一個用于基因組組裝的自動化軟件,在基因組研究方向上產出標志性成果。


    梁承志研究員介紹



            梁承志,博士,研究員, 博士生導師

            1989年畢業于武漢大學獲得遺傳學學士學位,1995年于中科院遺傳所獲得遺傳學博士學位,2001在加拿大Waterloo大學獲得數學與計算機科學碩士學位。2001-2012年先后在加拿大Bioinformatics Solutions Inc公司、美國紐約冷泉港實驗室、菲律賓國際水稻所從事生物信息研發工作。2012年2月回國,中科院引進杰出技術人才(百人計劃B類),現擔任中科院遺傳發育所生物大數據分析平臺首席科學家。


            主要研究領域:

            1、基因組組裝和注釋。結合最新的測序技術,包括PacBio實時單分子測序、大片段測序(比如fosmid或10x Genomics)、BioNano單分子圖譜,遺傳圖譜或Hi-C,完成基因組的組裝,并利用基因表達的證據進行基因注釋。

            2、比較基因組和群體基因組分析。對水稻、小麥、苦蕎、金魚草等多個物種進行了比較基因組分析,發現了導致各個物種各自在進化上的一些關鍵特征的相關遺傳基礎。

            3、生物信息軟件和數據庫開發。在基因組組裝方面,開發了一個基于單分子長片段測序的組裝基因組復雜區域的軟件HERA,在現有軟件的基礎上大大提高了基因組的組裝質量,也提高了分離高雜合二倍體基因組的能力。在數據庫建設方面,構建了一個包括多個參考基因組、基因組注釋和群體遺傳多態信息,應用于功能基因組研究和分子育種的知識庫。



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